Protein structure prediction from analogy. I. New database of spatially similar and dissimilar structures of protein domains for testing and optimization of prediction methods

M. I. Lobanov, N. S. Bogatyreva, D. N. Ivankov, A. V. Finkel'shteǐn

Результат исследований: Вклад в журналСтатьярецензирование

1 Цитирования (Scopus)

Аннотация

The paper describes creation and analysis of a database 3Dfold_test. This database consists of a large set of pairs of spatially-similar structures of protein domains and of an accompanying, much larger control set of "decoys", i.e., spatially-dissimilar protein structures, having approximately the same size and compactness as each member of a pair of spatially-similar proteins. The database 3Dfold_test can be found at the site http://phys.protres.ru/resources/prediction analogy/3Dfold/.

Язык оригиналаАнглийский
Страницы (с-по)722-732
Число страниц11
ЖурналMolekulyarnaya Biologiya
Том43
Номер выпуска4
СостояниеОпубликовано - июл. 2009
Опубликовано для внешнего пользованияДа

Fingerprint

Подробные сведения о темах исследования «Protein structure prediction from analogy. I. New database of spatially similar and dissimilar structures of protein domains for testing and optimization of prediction methods». Вместе они формируют уникальный семантический отпечаток (fingerprint).

Цитировать